乙方不支付农民工工资，甲方已经支付工程款了

乙方不支付农民工工资，甲方已支付工程款，乙方应承担法律责任。依据《劳动法》等相关法律，乙方需按时支付工资，拖欠工资属违法行为。若不及时处理，可能导致农民工生活困难，引发社会不稳定，且乙方需承担法律责任及赔偿。
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乙方不支付工资，常见处理方式为投诉与仲裁。应先向劳动监察部门投诉，若效果不佳，则收集证据申请劳动仲裁，以法律手段维护农民工权益，选择方式需根据实际情况判断。
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乙方欠薪，甲方已付款，处理如下：1.立即向劳动监察投诉，填写投诉表，说明情况。2.若投诉无果，整理工资条、合同等证据，申请劳动仲裁。3.仲裁期间，保持沟通，寻求和解；若仲裁裁决仍不满足，可诉诸法院。